結膜炎診斷方法主要是臨牀檢查、病原學檢查。
第一通過臨牀檢查,臨牀症狀和主要體徵出現的部位不同,有助於結膜炎的鑑別診斷。發現結膜濾泡和乳頭的位置、形態、大小是診斷和鑑別診斷的重要依據,沙眼的炎症上瞼結膜較下瞼嚴重,濾泡常出現在上瞼結膜邊緣部,而濾泡常出現在上瞼結膜邊緣部,而包涵體性結膜炎更常見。
第二根據病原學檢查,爲病因診斷和正確治療,有時必須進行病原學檢查。結膜分泌物塗片有助於診斷是否有細菌感染,如淋球菌引起的結膜感染,在結膜上皮細胞和中性粒細胞內可發現雙排列的淋球菌。可做細菌培養、真菌培養、藥物敏感試驗等。
結膜炎不同類型,細胞反應也不相同,結膜刮片的取材部位應選在炎症最明顯的區域,以提高檢出率,若病變波及瞼結膜,則上瞼結膜是理想的取材部位。