一、病因
本病病因尚不十分明了。
有人认为是小儿生长发育期植物神经功能尚不稳定，出现迷走神经亢进症状，使胃肠平滑肌痉挛产生腹痛。
有人认为本病小儿的痛阈值较正常人低，故对疼痛的敏感性增高。
国外学者注意到功能性复发性腹痛的主要原因是“心理状态不协调”，在个性测验中，腹痛儿童的“内向”分显著偏高，其发生腹痛多与激动、惩罚和家庭纠纷等心理因素有关。
国内学者也强调家长的生活方式、行为习惯对儿童个性、心理的形成及疾病的发生都起着重要的作用。
诱发腹痛的病因很多，大致可分清症状性、消化道功能性与器质性三种。
1、症状性：
多为肠道外疾病引起，如上呼吸道感染，化脓性扁桃体炎，肝、胆疾病，泌尿系疾病，肠道寄生虫病均可引起腹痛。
肠寄生虫病在既往曾是腹痛的最常见病因，近年来由于饮食卫生的改善，肠寄生虫病已明显减少，尤其在城市。
2、腹腔内器质性疾病：
如溃疡病，阑尾炎，肠梗阻，肠穿孔、脾脏破裂、急腹症等。
3、功能性：
反复突然发作的阵发性腹痛，疼痛部位多在脐周，程度轻重不一，重时可影响饮食及正常学习和生活，可出现哭闹不止、翻滚，甚至面色苍白、手足发凉、恶心、呕吐等症状，但发作间歇无异常体征。
最多见的病因是饮食不当、乱吃零食，过食冷饮，便秘，消化功能紊乱引起的腹痛(亦称功能性消化不良)。
4、其他：
(1)精神性：
国外亦有报告认为与小儿心理因素障碍有关，如紧张、压抑等。
(2)慢性胃炎及幽门螺杆菌感染：
近年来的研究认为再发性腹痛与慢性胃炎及幽门螺杆菌感染有关。
二、发病机制：
消化功能紊乱引起的肠痉挛的机制为不消化的食物在肠腔内发酵、产气刺激肠壁，或副交感神经兴奋，引起一过性肠壁肌肉痉挛，暂时阻断肠内容物的通过，于是近端肠管发生强力的收缩及蠕动的紊乱，随着蠕动的加强，腹痛阵发性加重。
经过一定时间的痉挛后，肠壁肌肉自然松弛，腹痛暂时缓解，以后又可再次发作。
腹腔器官本身痛觉并不敏感。腹痛的发生大体上可有3种形式：
1、绞痛：
多由管状器官的肌肉痉挛或梗阻(同时伴痉挛)引起，如肠管、胆管及输尿管痉挛或梗阻，多表现为阵发性绞痛。
2、钝痛 ：
由器官被膜受牵扯引起，如肝、肾、阑尾及腹膜等炎症肿胀所引起的被膜牵扯，多表现为持续性钝痛。疼痛部位多与器官病变所在的部位一致。
3、迁移性痛：
内脏疼痛通过内脏感觉神经传入相应的脊髓段，使进入相同节段的体神经支配部位感觉疼痛，如肝、胆病的疼痛有时可放射到右肩。
此外，腹部以外的器官疼痛有时也可放射到腹部，如大叶肺炎，带状疱疹侵犯腹部脊神经时都可出现较重的腹痛。破伤风的腹肌痉挛也可致剧烈的腹痛。
