8.1皮肤型系统性红斑狼疮
SLE引起的皮肤病变需与相应的单纯皮肤疾病相鉴别， ACLE和DLE需与脂溢性皮炎鉴别，后者除与前者一样有红斑性皮损外，还伴有毛孔粗大、皮肤呈油性，皮损还可发生于鼻尖，而LE性皮损一般不累及鼻尖；播散性DLE需与多中心网状组织细胞增生症鉴别，后者关节症状明显，且可导致畸形，皮损以丘疹、结节为主，组织病理示网状组织细胞肉芽肿；SCLE还需与寻常性银屑病鉴别；CCLE中的冻疮样狼疮还需与冻疮、多形红斑鉴别。
8.2关节炎鉴别
临床上常将关节型为主的SLE诊断成RA，或将特有的指关节半脱位和挛缩（Jaccoud综合征）与类风湿关节炎的手畸形混淆，两者在外观上较难区别，前者具有多种抗体，或伴有其他内脏损害或血液系统损害，关节影像学多仅为软组织改变而无骨破坏或关节腔狭窄，后者的X线显示可显示骨质脱钙、骨与软骨的破坏、掌指关节和近端指间关节间隙消失，损害局限于小关节，全身症状轻或无；血清学检查也有助于鉴别。
8.3浆膜炎
SLE往往表现为多浆膜炎（心包、胸膜），即使单纯性胸膜炎也以双侧为多，血清免疫学异常；感染引起的浆膜炎多为单浆膜炎（心包炎或胸膜炎）；肿瘤性胸膜炎与感染性胸膜炎都以单侧为多，可伴有疼痛，穿刺检查肿瘤性积液可呈血性，还可找见肿瘤细胞，感染性可从穿刺液中培养出致病菌；低蛋白血症引起的多浆膜腔积液都见于疾病后期，不难鉴别。
8.4急腹症
狼疮性胆囊炎、狼疮性胰腺炎、狼疮性腹膜炎、狼疮性肠系膜血管炎、狼疮性假性肠梗阻等与相应的外科急腹症较难区别，多会误行剖腹探查术。对育龄期女性出现高热、皮疹或关节痛、外周血白细胞不升高或降低的急腹症患者都应排除是否为狼疮所致。
8.5全血细胞减少
除与原发造血系统疾病相鉴别外，还需与感染、少见的噬血综合征等相鉴别，这些疾病类似于SLE的突然起病、高热、血管炎样皮损、出血倾向和全血细胞减少，血清学检查可资鉴别。
