本病需与以下疾患进行鉴别：
1.(单纯)胸椎椎间盘突出症 临床症状与胸椎椎管狭窄症基本相似，惟发病快，多呈急性状态，但行X线、CT及MRI等检查后，易于鉴别。
2.脊髓空洞症 多见于青年人，好发于颈段及上胸段，发展缓慢，病程长，有明显而持久的感觉分离，痛、温觉消失，触觉和深感觉保存，蛛网膜下隙无梗阻，脑脊液蛋白含量一般正常，MRI检查显示脊髓内有破坏灶。
3.脊髓侧索硬化症 主要表现为较为严重的上运动神经元和下运动神经元损害症状，却无感觉障碍。
4.胸椎间盘突出症 患者的症状和体征与胸椎椎管狭窄症的症状相似，但临床表现多变，发病较急，常呈突发性，无典型的综合征。CT脊髓造影及MR检查均有利于二者的鉴别。一般不难作出正确的诊断。
5.椎管内肿瘤 患者的表现为进行性加重的脊髓受压症状，腰椎穿刺检查脑脊液，可发现蛋白含量的增加程度远比胸椎椎管狭窄症患者要明显，常常超过1000mg/L。通过脊髓造影的特殊形态(如倒杯状、梭形等)和CT脊髓造影、磁共振检查常可作出明确诊断。此外，胸椎转移性肿瘤患者的全身情况很差，可能找到原发灶。
6.其他 胸椎椎管狭窄症尚需与外伤性硬膜外血肿、单侧后关节突骨折、蛛网膜囊肿、胸椎结核、脊髓蛛网膜炎及中毒引起的脊髓病等相鉴别。
