与其他相似性病鉴别：
1.软下疳 病原菌为杜克莱嗜血杆菌(Ducrey bacillus)。损害炎症显著，疼痛剧烈，经过急剧，伴有急性淋巴结炎。有不正当性交史。
2.硬下疳 数目多为单个孤立，溃疡边缘整齐，有软骨样硬度，周围有堤状浸润。愈后结浅薄瘢痕。损害中能查见梅毒螺旋体。
3.尖锐湿疣：男性患者好发于包皮系带、冠状沟、包皮、尿道、阴茎、肛门周围和阴囊。病症初期为淡红或污红色粟状大小赘生物，性质柔软，顶端稍尖，逐渐长大或增多。可发展成乳头状或囊状，基底稍宽或有带，表面有颗粒。
其他类型的有阴茎丘疹的疾病：
1.增殖性红斑：表现是龟头处出现单个或数个红斑，可为圆形、环形或不规则形，边界清晰，略高而硬，表面光亮。有时可有糜烂、结痂或乳头样增生。该病可多年无变化，也可能癌变。主要发生于包皮过长者。
2.固定药疹：圆或椭圆形红斑，边界清楚，数目多少不一， 大小不定，还可能合并水疱。中央呈紫红色肿胀，周围色红，局部可有痒或灼热感。破溃后形成湿烂面，经十多日才能愈合，且多遗有色素沉着，须经数月至一年才能逐渐消退。以后，患者每服该致敏药物，患处皮疹就会复发，而且面积会越来越大。
3.股癣：多见于臀部和大腿上内侧，但也常侵犯阴茎。初起为小丘诊(小疙瘩)，奇痒，然后扩大形成边缘呈环状凸起，中央平坦的圆形或多形性皮损，常见脱屑。
4.牛皮癣：可仅发生在阴茎而其他部位没有，所以不易识别，表现为在阴茎头部有边缘清楚的红斑丘疹，没有一般牛皮癣所特有的银白色鳞屑，若长在阴茎干上可有鳞屑。
5.绒毛状乳头状瘤：有粟粒样肿物，呈粉红色乳头状突起，排列成行。 阴茎勃起时突起尤为明显，较硬。平时无疼痛等不适。
6.珍珠状阴茎丘疹病：皮损为白色、肤色或淡红色小丘疹，单个直径1-3mm，半透明，形似小珍珠，表面光滑。可呈几个针尖大的细珠状。亦可呈丝状或尖锐毛状。皮疹互不融合，沿龟头后缘冠状沟排列一行或数行，可部分或全部环绕龟头。多见于20-50岁青壮年。
