诊断上需对咽食管憩室，膈上憩室，食管中段憩室，假性食管憩室进行鉴别：
(1)咽食管憩室的诊断及诊断标准：临床物理检查阳性体征不多部分患者在吞咽几口空气后反复压迫环咽肌水平胸锁乳突肌前缘可听到响声。
诊断的主要手段是X线检查，平片上偶见液平面服钡可见食管后方的憩室，若憩室巨大明显压迫食管，可见到钡剂进入憩室后再有一条钡剂影，自憩室开口流向下方食管造影时反复变动体位，有利于憩室的充盈和排空。便于发现小憩室及观察憩室内粘膜是否光滑，除外早期恶变。
(2)膈上憩室的诊断及诊断标准：膈上憩室常由胸部X线检查确诊，胸部平片有时可看到含液平面的憩室腔，服钡造影在膈上几厘米处见到憩室常突向右侧，亦可突向左侧或前方，膈下腹段食管出现憩室的情况极为罕见，憩室可以同时合并裂孔疝，造影时需多方位观察，以免漏诊或误诊，内窥镜检查有一定危险，只在怀疑恶变和有合并畸形时进行。
(3)食管中段憩室也同样依靠X线确诊，服钡造影时要采用卧位或头低脚高位，并左右转动体位才能清晰地显示憩室的轮廓，因为食管中段憩室的开口都比较大造影剂很容易从憩室内流出，不易在内存留。
(4)假性食管憩室的诊断及诊断标准：X线检查时不能发现假性憩室，服钡造影可发现食管腔内有多发的长颈烧瓶状或小钮扣状小囊袋1～5mm大小不等，呈散在性或局限性分布管明显狭窄处，假性憩室亦较多，故认为食管狭窄与假性憩室周围炎症有关，内窥镜检查食管呈慢性炎症改变，仅在极少数患者中见到假性憩开口，活检亦不易确诊。
