1.食管胃十二指肠镜(EGD) 是最常应用的检查方法，其可深达十二指肠第4段，排除其他胃、十二指肠的出血。若发现十二指肠第3或第4段有黏膜缺损、血块或发现移植血管壁或其吻合口的缝线，则可明确诊断。EGD检查的确诊率约80%。在手术室中检查最理想。
2.增强CT检查 腹部及盆腔CT对于不明原因的败血症有一定的帮助，在AEF的患者，CT检查可发现于移植血管的周围有液体或气体，除此，CT检查若发现移植血管周围组织肿胀或炎症，动脉钙化边缘周围气体，假性动脉瘤，附近肠道壁增厚等。
3.血管造影 有时可见血管吻合口的远或近端的假性动脉瘤和造影剂流入肠管，则可明确诊断。但因血流速极快，很少见到典型的X线征。虽如此，血管造影可提供动脉解剖的特征及设计再手术。
4.MRI成像 虽有一定的准确性，但其诊断AEF的价值仍存在一些问题。MRI成像检查有可能准确检出移植血管是否有感染。若MRI检查发现移植血管周围于手术后3月仍有积液，则提示有感染，结合临床的其他指征可作出诊断，移植血管的肌肉，其信号强度增加，onT2-Weogted影像，则亦揭示感染的可能。
5.胃肠道钡剂检查 应尽量避免应用，纵然可得出诊断，但钡剂流入血管内有一定风险。X线平片检查，前已叙述其用途。另若病情稳定，不是大量消化道出血，可应用标记红细胞核扫描，检出其出血的部位。
6.其他检查 若病情稳定，不是大量消化道出血，可应用标记白细胞扫描，检出其出血部位。另外结肠镜、腔窦X线照相(Sinogram)等亦均有助于诊断。
7.血常规检查 假动脉瘤继发血肿感染时，白细胞计数增加，中性粒细胞比例增加。
8.细菌学培养 发生血肿感染时，血培养和伤口分泌物培养可有细胞生长。75%为金黄葡萄球菌、表皮葡萄球菌或大肠埃希菌。术前血液细菌培养与再次手术时的移植血管及其周围组织培养，菌种一致。
