一、实验室检查
1.血象
溃疡型肠结核可有中度贫血。无并发症者白细胞计数正常，但淋巴细胞增多。90%的患者血沉明显增快。
2.粪便检查
溃疡型肠结核粪便外观糊状，无黏液脓血，镜检可见少量脓细胞和红细胞。粪便浓缩找到MTB同时痰菌阳性具有诊断意义。合并肺结核者痰菌可阳性，对诊断有参考意义。
3.结核菌素试验
可为阳性或强阳性，强阳性对增生型肠结核诊断意义较大。
4.聚合酶链式反应
聚合酶链式反应(polymerase chain reaction，PCR)又称DNA体外扩增技术。PCR技术在基因水平上为结核病原学快速、敏感、特异诊断开辟了新的途径。
二、影像学检查
1.X线检查
X线钡餐造影包括双重对比或钡剂灌肠检查对肠结核的诊断具有重要意义。鉴于钡餐检查除可明确胃肠的器质性病变外，还可了解其功能性障碍，故应属首选。对有并发肠梗阻者，最好进行钡剂灌肠，因为钡餐可以加重肠梗阻，往往促使部分性肠梗阻演变为完全性肠梗阻;对病变累及结肠的患者宜加用钡剂灌肠检查，常可更满意地显示结肠器质性病变。
在溃疡型肠结核，病变的肠段多有激惹现象，钡剂进入该处排空很快，充盈不佳，病变上下两端肠曲钡剂充盈良好，称为X线钡影跳跃征象。在回盲结核，由于盲肠和其邻近回肠有炎症、溃疡，该处往往不显影或显影极差，回肠末段则有钡剂潴留积滞。病变的肠段如能充盈，可因黏膜遭破坏而见皱襞粗乱，肠的边缘轮廓不规则，且由于溃疡，而显锯齿状征象。当病变发展过程中纤维组织增生，有时可见肠腔变窄，肠段收缩变形，回肠盲肠正常角度丧失，回盲瓣硬化并有盲肠内侧压迹。此外，伴有肠功能紊乱常使钡餐在胃肠道运动加快，于12h内几乎全部排空，小肠有分节现象，并见钡影呈雪花样分布。病变广泛并涉及各段结肠者，其X线征象可酷似溃疡性结肠炎的表现，但结肠结核多同时累及回肠末端，病变则以结肠近段为主，下段即使累及，病变较轻。
增生型肠结核主要表现为盲肠或同时升结肠近段，回肠末段的增生性狭窄，收缩与畸形，可见钡影充盈缺损，黏膜皱襞紊乱，肠壁僵硬，结肠袋形消失，往往因部分梗阻而使近端肠曲明显扩张。
2.乙状结肠镜和纤维结肠镜检查
一般肠结核患者不作为常规检查措施，但在重症患者病变涉及乙状结肠下段或直肠者。可借助乙状结肠镜检查和直视下采取活组织检查，以明确溃疡的性质与范围，对诊断与鉴别诊断有很大的帮助，用纤维结肠镜检查可察看升结肠，盲肠和回肠末段的病变，并可作活组织检查及照相等，对本病诊断有重要价值。病变部可见肠壁僵硬黏膜充血、水肿，触碰易出血，结节状或息肉样隆起，有时可见边缘不规则的潜行溃疡，黏膜活检可有结核结节及干酪样坏死或查到抗酸杆菌是确诊最有力的依据。
3.腹腔镜检查 对腹腔无广泛粘连，而诊断又十分困难的病例，可以考虑做腹腔镜检查，病变肠段浆膜面可能有灰白色小结节，活检有典型的结核改变。
