引起肛门剧痛的病因主要有以下几种：
1.肛周脓肿:本病较常见,就是俗称为“脓包”的疾病。肛门旁可以扪及一个肿块，触痛明显，如果位置较深可以伴有发烧。此病疼痛较剧烈，活动时加剧，如果位置较浅可自行破溃并有脓汁流出。治疗：立即手术行脓肿一次性根治术，每日换药2次，如果仅仅单纯排脓，可能再次复发。脓汁不放出，光靠输液用消炎药有时治疗无效，切开后疼痛立即大大地缓解。
2.内痔嵌顿:常见于患有混合痔的患者,因大便干燥、蹲时间长、着凉、着急上火等多种原因，导致混合痔发炎水肿，内痔脱出，由于肛门括约肌痉挛，使脱出的内痔血液循环不畅，进一步加重水肿，形成恶性循环，越肿越大，产生剧烈的疼痛。
治疗：立即到肛肠医院在麻醉状态下，使肛门括约肌松弛，将脱出部分送回肛门内，经过抗炎和局部换药使炎症消退，再通过手术彻底根治。
3. 肛裂:一般疼痛能够忍受，但有个别病例也能产生剧烈的疼痛，往往发生在排便后，疼痛时间几十分钟至几小时不等。慢性肛裂可以引发多种肛肠疾病，最多见的是肛周脓肿和肛瘘。
治疗：这样程度往往需要手术治疗。
4. 肛管直肠癌晚期:剧痛
治疗：药物止痛无其他方法。
5. 肛门异物:疼痛较剧烈，有时可以并发肛门脓肿。一般是由于不慎误吞鱼刺、枣核、排骨等物，排便时卡在肛门口，刺入肛门的组织并引起局部感染。
