清流县医院创建于1938年2月，系一所就医环境优美、技术力量雄厚、医疗设备精良、服务品质优越，集医疗、科研、教学、预防、保健、康复为一体的二级甲等综合性医院。2003年以来先后与福建省立医院、福建省协和医院心胸外科研究所、南京军区福州总医院和福建医科大学附属第一医院建立协作、帮扶关系。
医院设本部和灵地分院，总占地面积5万平方米，编制床位400张（其中灵地分院50张）。现有职工380人，其中卫生专业技术人员320人，具有中高级职称110人，设有12个职能科、17个一级临床科室和8个医技科室。年门急诊量15万人次，年收治住院病人1万人次，年手术约4000台。
医院医疗设备先进，技术力量雄厚，目前，拥有16排螺旋CT、核磁共振、德国史托斯微创手术系统、数字化摄影（DR、CR）、数字胃肠机、电子进口胃肠镜、全自动生化分析仪、PCR实验室等先进的诊疗设备。除开展常规诊疗项目外，已成功开展重型颅脑外伤救治、纵隔肿瘤切除、肺癌根治术、动力髋内固定、药物溶栓、椎间盘微创介入治疗术、颅内血肿微创抽吸等复杂手术及各种急危重症抢救。微创技术、无痛技术、肛肠手术为医院特色技术，临床经验丰富，居全市二级医院领先水平。近年来，医院开展新技术、新项目30余项，其中2项获市科技进步奖，3项获县级科技进步奖。
医院秉承“以病人为中心、以医疗质量为核心”的服务宗旨，坚持 “德术并举、敬业创新”的办院方针，以“花园式医院、家庭化病房、规范化诊疗、人文化关怀、亲人化服务，建设人民群众满意的闽西北新型医院”为发展目标，内强素质，外塑形象，狠抓软硬件建设，各项工作取得长足进步。医院先后荣获“全省卫生系统院务公开先进单位”、“三明市平安医院“、“市卫生系统医院管理先进单位” 等称号，连续五届被评为三明市“文明单位”，连续六年被评为市“红十字会先进集体”，获三明市第六、第七届“文明行业创建示范点”称号。
1、创建于1938年2月，全称为清流县卫生院，院址在城关寺前街《惜阴学舍》，时有医生、助产各1人。
2、1950年2月2日，清流解放，县人民政府接收经筹备至当年10月，名称为清流县卫生院，全院人员6人，院址同上，1953年7月迁往城关塔背窠，人员增至26人。
3、1957年2月更名为清流县医院。清流与宁化合并后更名为清流县第二医院，1967年11月工人进驻县医院，12月更名为清流县工农兵医院；1969年12月福建省协和医院104名医务人员下放到清流，月底与县防疫站合并，改名为清流县人民卫生防治院；1971年12月与防疫站分离，改名为县中心医院，迁到现址长兴中街218幢（原称城关西坪路1号），1976年复名清流县医院。
