微山县中医院始建于1985年，是一所集医疗、教学、科研、预防保健、康复于一体的二级甲等中医医院。
医院地处县城奎文东路56号，占地面积6600平方米，建筑面积4200平方米，编制床位100张。在职职工120余人，其中高级职称13人，中级职称49人，卫生专业技术人员占职工总数85%。设有15个临床业务科室、9个行政后勤科室，其中疼痛科为省级重点专科建设项目、妇科、肛肠科为市级重点专科建设项目。
疼痛科2018年加入济宁市针灸专科联盟并成为理事单位，2019年被定为山东省儿童青少年近视小儿推拿防控县级基地。妇科先后被评为“济宁市特色中医专科”、“济宁市‘十二五’中医药重点专科”。肛肠科2017年与中日医院建立国家临床重点专科肛肠专科医联体单位，2018年与济宁市第一人民医院建立鲁西南肛肠外科专科联盟单位，并于2018年报济宁市卫健委审批正式加挂微山县肛肠病医院第二名称。
医院秉承“中医为本、发展专科、品牌立院、诚信为民”的办院宗旨，以“仁爱、精诚、传承、创新”作为全院医务人员共同遵守的医院院训。
近年来，医院先后投资了500余万元购置设备，目前我院共有设备160余台，其中中医设备122台，占总设备的75%。医院不断加强基础设施建设，极大地改善了就医环境，进一步优化了服务流程；加强内部管理，强力推进制度建设和落实；强化质量管理，规范诊疗行为；勇于开拓创新，加强技术协作，注重引进新技术。医院专业技术水平和综合服务能力得到了大幅度提高，社会效益和经济效益得以明显提升，社会信任度和美誉度也得到了明显提高。医院多次被市县卫生主管部门授予“济宁市文明单位”、“中医工作先进集体”、“卫生工作先进单位”、等诸多荣誉称号。
