(1)SLE：根据检测方法及其分析灵敏度的不同，抗磷脂抗体在SLE中的阳性率可达15%～70%。该抗体阳性的SLE患者，与动脉及静脉血栓、习惯性流产、血小板减少、Coombs阳性的溶血性贫血和某些罕见的症状相关，但其相关程度和各种检测方法对这些症状的临床灵敏度和特异性，各家报道并不一致。高滴度的抗心磷脂IgG类抗体，阳性狼疮抗凝集试验的异常，疾病静止期抗体的阳性，是这些病症高风险的指标。回顾性研究发现，抗磷脂抗体先于这些症状而出现。
(2)原发性抗磷脂综合征(APS)：如患者出现血栓、习惯性流产、血小板减少、溶血性贫血、网状青斑、各种神经症状以及抗磷脂抗体阳性，不符台SLE或其他疾病诊断标准，则可诊断为原发性APS。小部分转归为SLE。
(3)其他疾病
抗磷脂抗体不是SLE或APS特异性抗体，它们在下列病症中以不同频率存在：
多种风湿性和非风湿性疾病，如风湿性关节炎、青少年慢性关节炎、强直性脊椎炎、牛皮癣性关节炎、各种结缔组织病和脉管炎，多肌痛性风湿和风湿热。
血液学上，骨髓增生和淋巴瘤疾病。
心肌梗死。
艾迪生病。
药物诱导的狼疮综合征。
多种病毒感染，如HIV、EBV、微小病毒B19;细菌感染，如螺旋体病、梅毒、结核、洛矶山斑疹热以及原虫感染。
5%健康人，随年龄增高阳性率上升。
除了原发性APS或SLE，这些抗体和前述病症之间通常没有相关性。另外，HLA等位基因DRw53和DR4或DR7只与原发性APS相关，某些情况下，与抗磷脂抗体阳性的SLE相关。
