病因：
虽然有多种重要理论，但目前AS的确切病因尚不清楚。首先，遗传因素起重要作用。虽然已经肯定HLA-B27和本病的发病机制有直接关系，但其病理生理作用还不明了，而且非MHC基因也和本病的发病风险相关。其次，软骨似乎是异常免疫反应的重要靶组织。第三，伴有TNF-α过度表达的细胞因子失调，以及炎性肠炎是本病的突出特点。第四，有证据表明，骨形成蛋白在强直性脊柱炎的发病机制中具有一定作用。
（一）遗传因素
1.MHC类基因
（1）HLA-B27
AS是一种具高度遗传性的疾病，最近关于AS的家系和孪生研究显示，存在遗传易感性多基因模式。HLA-B27基因是人类MHC类分子B位点上的等位基因，它位于人的第6号染色体的短臂上，由8个外显子和7个内含子组成，编码分子量为43Ku的糖蛋白。HLA-B27分子由α链(重链)和p链(轻链，即β2微球蛋白)2条多肽链组成。
HLA-B27是一种与强直性脊柱炎相关的致病基因，其相关强度居于与HLA有关联的疾病之首，其编码的B27抗原在细胞免疫应答中起着重要作用。HLA-B27基因具有广泛的地理分布，携带情况存在种族和地区差异，欧洲、北非、北美、东方人均发现携带，而在南美、澳大利亚未与外界通婚的土著人中未发现HLA-B27，亦不患AS，并且发病与该地区人群中的HLA-B27频率有关。有报道证实，强直性脊柱炎患者的HLA-B27阳性率在83%～95%之间，而正常人群HLA-B27阳性出现的频率平均大约为4%～8%之间。据流行病学调查，在HLA-B27阳性人群中，强直性脊柱炎的发病率较高，可达20%左右，强直性脊柱炎患者的一级亲属中HLA-B27阳性者非常易患本病，患病率可达11%～24%，比一般的HLA-B27阳性群体高10倍，比正常人群高出120倍甚至高200倍。
（2）HLA-B基因
通过对同卵和异卵双胞胎As患者研究发现HLA-B27与AS的相关性大约只占16%。提示除了HLA-B27外，其他的基因也可能与AS具有相关性。国外资料显示，HLA-B60是次于HLA-B27的AS易感基因。据统计，同时携带B27和B60的人AS的发病可能性是仅B27阳性者的3-6倍，且症状重。2004年在中国台湾的研究发现：HLA-B60和B61独立于HLA-B27与AS强相关。在加拿大的AS多发家系中也发现HLA-B40(B60、B61)对B27阳性AS患者有35%的危险性。在墨西哥混血儿中所做调查显示，AS不仅与HLA-B27连锁，也与HLA-B39连锁。HLA-B39与HLA-B27在B口袋上结构很相似，且在B27阴性的AS患者中频率增高。西班牙的AS患者的调查研究中发现，HLA-Ag(A*2402)在AS患者中的频率明显高于B27阳性的健康对照组，且在外周关节炎的患者中也有所增高。
（3）HLA-DR基因
近年来，HLA-DR与AS的关联在不同人群中均有报道，英国发现DRI、DRS在AS患者组中明显增高，且DRI纯合子更易致病，认为DRI是不依赖于B27而与AS关联，而DR12与AS呈负相关。但在国内实验结果认为，DPBI*0401在B*2704发个体中具有降低AS易感性的作用。法国SpA家系研究中发现，SpA患者中DR4等位基因比HLA-B27阳性健康同胞有明显的异常传递，其余的DR等位基因未见这种异常，这提示SpA患者DR4的传递可能不依赖HLA-B27而独立进行，进一步说明了HLA-DR是AS的易感基因。
（二）感染因素
60％以上的AS患者出现亚临床炎症改变，血清IgA抗体水平明显升高，且血清浓度与反应蛋白水平显著相关。研究发现，抗克雷白杆菌抗体与AS患者的肠道损害是密切相关的。研究者利用基因转殖技术将人类的HLA-B27植入老鼠体内的基因，这种转基因老鼠 (Transgenicmice)经过暴露于某些环境因素(如细菌感染)之后，也象人类一样会产生类似脊柱炎的症状且以腹泻而发病，而在无菌环境中培育的转基因鼠和携带HLA-B27基因数量少的大鼠则没有关节炎症和肠道病变出现。转基因鼠在无菌环境中，并不发生与SpA相似的病变，必须生活在有菌环境中才发病，提示环境因素是B27相关疾病发生不可缺少的条件。
创伤、内分泌、代谢障碍和变态反应等亦被疑为发病因素。总之，目前本病病因未明，尚无一种学说能完满解释AS的全部表现，很可能在遗传因素的基础上的受环境因素(包括感染)等多方面的影响而致病。
