肺真菌病的治疗方法主要包括药物治疗和手术治疗。
药物治疗方面，可根据病因选用抗感染（抗生素、激素）治疗，部分病人病灶有可能缩小。对于肺念珠菌病，可选用氟康唑、伊曲康唑等抗真菌药物进行治疗；对于肺曲霉病，可选用伏立康唑、泊沙康唑等抗真菌药物进行治疗；对于肺隐球菌病，可选用氟胞嘧啶、两性霉素B等进行联合治疗。
手术治疗方面，如果肺部炎性假瘤的体积较大，患者出现咳嗽、发热、咳痰等症状，可以采取肺叶切除术等方式，将病灶部位切除。对于2cm以上病灶无法诊断者也可以先进行肺穿刺或支气管镜取活检，明确病理。
此外，患者肺部真菌感染还可以通过补液、雾化等方式进行治疗。日常患者应保持营养均衡，增强免疫力。
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